実験だけの研究者から、Wet × Dry研究者へ。

今回、バイオインフォマティクス未経験の私にも分かるよう、目的タンパク質に対する低分子化合物ライブラリーを用いたin silico screeningの基本から丁寧に教えていただきました。コマンドラインすらわからない私がエラーを多発しながらも何とか仮装環境の構築から最終的にMDシミュレーションまで辿り着けたのはしずくさんのおかげで、本当に感謝しております。

また、技術書についても、つまづいた点、執筆時点では扱っていなかったツールやソフトウェアなどを加筆していただき復習もしやすいです（今後の更なる加筆も期待しております）。

私のPC環境ではMDシミュレーションをガンガン回すことが難しそうですが、今回の企画のおかげで私の中のバイオインフォマティクスに対する敷居は下がったように感じています。今回を機に、バイオインフォマティクス分野に対する理解をより深めたいという意欲が芽生えました。今後も継続して学び、より実践的なスキルを身につけたいと考えています。そして機会を作れたら、またぜひしずくさんの指導をもらいたいと思います。

これまでwetの実験を中心に研究を行ってきたため、dry解析やプログラミングにはあまり馴染みがなく、不安もありましたが、実際に手を動かしながら取り組む中で多くのことを学ぶことができました。

慣れないPython操作ではエラーが頻発しましたが、その都度丁寧にご指導いただき、ひとつひとつのステップを着実に理解しながら前に進むことができました。書籍を読むだけでは得られない、実践を通じた知識や感覚を身につけられたことは非常に有意義でした。

PCの性能の関係でMDシミュレーションの実行は叶わず、実際の計算は代行していただきましたが、その流れや意義が理解できました。また、in silicoスクリーニングの結果、研究の種となる可能性のある化合物を見つけられたことも大きな成果であり、論文投稿へと繋げていきたいと考えています。貴重な機会をありがとうございました。